События Prey разворачиваются в 2032 году на лунной орбите, на борту космической станции «Талос-1». Предполагалось, что эксперимент, в котором игрок принимал участие, должен был навсегда преобразить человеческую расу, но он обернулся катастрофическими последствиями. Станцию заполонили враждебные пришельцы, которые в настоящее время пытаются игрока уничтожить.